從2006年以來，拜耳作物科學遭美國約1.1萬農民的起訴，起訴其轉基因水稻污染到其他水稻品種并影響到出口品質。最終，拜耳作物科學敗訴，將支付原告7.5億美元賠款。

    2006年8月，拜耳作物科學與路易斯安那大學曾對水稻品種進行測試，在學校克羅利的一處實驗田中培育抗Liberty除草劑品種，造成了轉基因品種在長粒水稻中的痕量殘留，污染范圍超過美國水稻種植面積的30%。污染的新聞一出，四天內，使水稻價格走低了14%，并且，使水稻出口至歐盟、日本、俄羅斯及其他國家受阻，訂單暫停或者推遲，損失了約1.5億的種植成本。
 
    2006年-2009年間，來自美國德克薩斯州等五個州的約1.1萬農民起訴拜耳作物，要求其必須采取措施并為美國水稻種植戶的損失負責，索賠金額高達7.5億美元。此次訴訟原告占到美國長粒水稻種植者的至少85%，經過長期的訴訟，原告終于得以勝訴。

    拜耳作物科學已經表示接受了賠款判決。其發言人表示，雖然拜耳作物自信在處理轉基因水稻時慎之又慎，但為了使公司能貫徹專注于為現代農業提供創新解決方案的宗旨，公司認為合理解決此次訴訟更為重要。