近年來，辣椒病毒病發生較重，辣椒一旦受到病毒病嚴重危害，只長莖葉不長果實，最終導致辣椒減產，甚至絕產。常見辣椒病害：辣椒灰霉病、辣椒病毒病、辣椒疫病。
　　一、病毒病的種類及識別
　　辣椒病毒病主要有花葉型、畸形、壞死型、條斑型。其中壞死型發病急，蔓延速度快，危害大。花葉型發病時植株項部葉片呈明顯黃綠相間魄花葉，有的葉面皺縮，明顯的褐綠斑駁，是常見的一種病毒。畸形（厥葉型或卷葉型）病毒，葉片畸形，初期有心葉葉脈皺縮，以后病葉增厚，葉緣向上卷曲，幼葉狹窄或出現線狀，后期植株上部明顯呈叢簇狀，節間短，植株矮小，結辣椒少或不結辣椒。壞死病是病株頂部葉片基部或沿主脈變褐壞死，有的幼花柄部變褐壞死，引起落葉、落花、落果，頂端呈光桿。而條斑病主要發生在后期果實上，多是從果尖至上半部出現褐色條斑，凹陷、果實變黃。
　　二、發病規律
　　辣椒病毒病的主要病源是煙草花葉病毒和黃瓜花葉病毒。花葉型、條斑型病毒是由煙草花葉病毒侵染引起的，它毒力強，可侵染多種植物，煙草花葉病毒在土壤中的病殘體、種子或卷煙中過冬，主要通過田間農事操作，由葉片質液接觸傳播，特別遇到高溫、干旱天氣，有利于蚜蟲繁殖傳播。畸形病是由黃瓜花葉病毒侵染引起，寄生范圍很廣，主要在多年生雜草及保護地蔬菜上越冬，翌年由蚜蟲傳播。此外，重茬，干旱缺水，土壤缺鈣、缺鉀、缺鋅，管理粗放，苗小、定植晚等，均易引起該病流行。
　　三、防治方法
　　1、農業措施。
　　⑴選用抗病品種。一般葉細長、果實為牛角形或羊角形的辣椒比葉大而闊、果實為燈籠形的甜椒抗病毒病，耐熱品種比耐寒品種抗病毒病。較抗病的甜椒品種有農大22號、農發甜椒、農樂甜椒、中椒5號、充州1號等。
　　⑵種子消毒處理。用10%磷酸三鈉溶液浸種20-30分鐘，洗凈。或將充分干燥的種子置于70℃的恒溫箱內干熱處理3天。
　　⑶苗床消毒。選擇新茬地塊，起出苗床土，每立方米土加50%多菌靈100克拌勻過篩后填于苗床內，再用50%多菌靈加50%乙磷鋁錳鋅，按每平米各10克加細干土拌勻，撒入畦面劃鋤入土。
　　⑷適時澆水。高溫時可5-10天澆次水，增大溫差減輕發病。
　　⑸間作遮陽。采用先進技術，推廣應用遮陽網，防止高溫和烈日曝曬。
　　⑹采用與玉米、虹豆、菜豆、瓜類等高稈作物間作，避免強光高溫危害。
　　2、治蟲防病。幼苗期，定植緩苗期及中后期及早治蚜蟲防病。
　　3、農藥防治。目前防治病毒病尚無特效藥物，應以“預防為主”，根據現有的藥物配合使用，盡量抑制病毒病的發生。
　　⑴用5%菌毒清300倍液，1.5%植病靈500倍，硫酸鋅800倍（或高錳酸鉀1000倍）再加入綠芬威1號1000倍。
　　⑵用5%菌毒清300倍，20%病毒A500倍，磷酸三鈉500倍，再加黃腐鹽。
　　⑶2.8%克病靈500倍，辣椒靈1000倍再加葉面肥等。